Search Results (51)

Collaborative manual image analysis by multiple experts in different locations is an essential workflow in biomedical science. However, sharing the images and writing down results by hand or merging results from separate spreadsheets can be error-prone. Moreover, blinding and anonymization are essential to address subjectivity and bias. Here, we propose a new workflow for collaborative image analysis using a lightweight online tool named Tyche. The new workflow allows experts to access images via temporarily valid URLs and analyze them blind in a random order inside a web browser with the means to store the results in the same window. The results are then immediately computed and visible to the project master. The new workflow could be used for multi-center studies, inter- and intraobserver studies, and score validations. Full article

Image analysis plays a central role in orthopedics and research but comes with many challenges, including anonymization, bias, and achieving efficient analyses using multiple independent observers. Appropriate software is still lacking. Tyche is a free online tool that displays images in a random order without showing any metadata. Additionally, when using Tyche, observers can store results in the same window, and the final results are immediately visible to the project manager. In this study, we compared results from Tyche with those from a validated tool. One hundred pelvic radiographs were analyzed separately by five orthopedic surgeons using both Tyche and the validated software. Common orthopedic measurement modalities and scores were determined. The methods were compared using intra-class correlations and Fleiss’ kappa coefficients as well as Bland–Altman plots. Significant correlations ranging from r = 0.17 (Kallgren and Lawrence Score) to r = 0.99 (area measurements) were calculated for inter- and intraobserver agreements between the two tools for all measurements. The Bland–Altman plots indicated the non-inferiority of either tool. The images were analyzed significantly faster when Tyche was used. We conclude that Tyche is a valid tool for use in orthopedic image analysis. Tyche could be utilized for determining inter- and intraobserver agreements, in multicenter studies and for score validations. Full article

With population and income growth, the need for energy has increased in developing and emerging economies, which has inevitably led to an increase in carbon dioxide emissions (CO₂e). This paper investigates the impact of energy consumption on CO₂e influenced by population growth, energy consumption per capita, and income. In particular, this paper investigates whether or not an increase in energy consumption, energy intensity, energy consumption per capita, population growth, and income impacts CO₂e in China, India, and the USA. The study applied the non-linear Autoregressive distributed lag (NARDL) and machine learning techniques. We found a significant impact of energy consumption per capita on the CO₂ emissions in China, India, and USA. Furthermore, the results revealed that, when income increased, CO₂ emissions increased in India, but decreased in the USA. The results confirmed that population growth increases CO₂ emissions only in India. The results revealed that a decrease in energy intensity significantly improves the environmental quality in China and India. Finally, we forecasted the CO₂e trend from 2017 to 2025. The results revealed an upcoming increase in CO₂e levels in China and India. Conversely, the forecasted results demonstrated a downward trend of CO₂e emissions in the USA. Full article

Among lithium battery cathode materials, Li_1.2Ni_0.13Mn_0.54Co_0.13O₂ (LR-NMC) has a high theoretical capacity, but suffers from voltage and capacity fade during cycling. This is partially ascribed to transition metal cation migration, which involves the local transformation of the honeycomb layered structure to spinel-like nano-domains. Determination of the honeycomb layered/spinel phase ratio from powder X-ray diffraction data is hindered by the nanoscale of the functional material and the domains, diverse types of twinning, stacking faults, and the possible presence of the rock salt phase. Determining the phase ratio from transmission electron microscopy imaging can only be done for thin regions near the surfaces of the crystals, and the intense beam that is needed for imaging induces the same transformation to spinel as cycling does. In this article, it is demonstrated that the low electron dose sufficient for electron diffraction allows the collection of data without inducing a phase transformation. Using calculated electron diffraction patterns, we demonstrate that it is possible to determine the volume ratio of the different phases in the particles using a pair-wise comparison of the intensities of the reflections. Using this method, the volume ratio of spinel structure to honeycomb layered structure is determined for a submicron sized crystal from experimental three-dimensional electron diffraction (3D ED) and precession electron diffraction (PED) data. Both twinning and the possible presence of the rock salt phase are taken into account. After 150 charge–discharge cycles, 4% of the volume in LR-NMC particles was transformed irreversibly from the honeycomb layered structure to the spinel structure. The proposed method would be applicable to other multi-phase materials as well. Full article

Wstęp: W kilku ostatnich dekadach obserwuje się wzrost izolacji prątków niegruźliczych (NTM, nontuberculous mycobacteria), zwłaszcza w krajach rozwiniętych. Celem pracy była analiza wszystkich gatunków prątków niegruźliczych izolowanych z materiałów biologicznych od pacjentów w Polsce, w latach 2013–2017. Materiał i metody: Badaniem objęto 2799 izolatów, pochodzących głównie z układu oddechowego, które oceniano w referencyjnym laboratorium Instytutu Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie oraz w Wielopolskim Centrum Pulmonologii i Chirurgii Klatki Piersiowej. Wyniki: W badanym okresie izolowano 35 różnych gatunków NTM. Liczba izolatów wzrosła prawie 1,6-krotnie: od 420 w 2013 roku do 674 w 2017 roku. Najczęściej występowały: M. kansasii, M. avium, M. xenopi, M. gordonae i M. intracellulare. Dominacja tych gatunków NTM w prawie niezmienionej kolejności utrzymywała się przez cały okres. Natomiast przy rozpatrywaniu MAC (M. avium complex) jako całości—od 2015 roku kompleks ten dominował nad M. kansasii. M. avium i M. intracellulare częściej izolowano od kobiet, podczas gdy M. gordonae i M. xenopi od mężczyzn. Nie stwierdzono różnic w częstości występowania NTM u mężczyzn i kobiet. Wśród pacjentów po 65. roku życia dominowały kobiety, zaś u tych pomiędzy 25. a 64. rokiem życia—mężczyźni. Wnioski: W Polsce, podobnie jak w innych krajach, zwiększa się częstość izolacji NTM. Najczęściej izolowanymi gatunkami były: M. kansasii i M. avium. Prątki niegruźlicze występowały u kobiet i mężczyzn z podobną częstością. Full article

Wstęp: Do oceny skuteczności terapii u pacjentów leczonych z powodu zapalenia płuc na oddziałach intensywnej terapii niezbędne jest monitorowanie czynności płuc. Spośród technik przyłóżkowych szczególnie interesujące są ultrasonografia płuc oraz technika termodylucji przezpłucnej. Celem jednoośrodkowego badania obserwacyjnego była ocena korelacji pomiędzy badaniem ultrasonograficznym płuc (LUS, lung ultrasound examination) a parametrami objętościowymi termodylucji przezpłucnej, takimi jak wskaźnik pozanaczyniowej wody wewnątrzpłucnej (EVLWI, extravascular lung water index) i wskaźnik przepuszczalności naczyń płucnych (PVPI, pulmonary vascular permeability index). Materiał i metody: Przeanalizowano dane medyczne dwunastu pacjentów wymagających wentylacji mechanicznej i monitorowania hemodynamicznego metodą PiCCO (pulse index continuous cardiac output) z powodu świeżo rozpoznanego zapalenia płuc. Porównano wyniki badań ultrasonograficzych płuc przeprowadzonych w pierwszym i trzecim dniu terapii przeciwbakteryjnej z wartościami uzyskanymi metodą termodylucji przezpłucnej, wykonanymi w tych samych dniach. W celu oceny trendów obliczono różnicę między wartościami uzyskanymi w pierwszym i trzecim dniu. Wyniki: Nie znaleziono korelacji pomiędzy badanymi zmiennymi, z wyjątkiem korelacji między PVPI i EVLWI, zarówno mierzonymi w tym samym dniu (Rho = 0.3; 95% CI −0.02–0.59; p = 0.03), jak i w trzydniowym trendzie (Rho = 0.6; 95% CI 0.2–0.8; p = 0.005). Wnioski: Wyniki badania wskazują, że parametry wolumetryczne uzyskane za pomocą metody PiCCO oraz badanie USG płuc powinny być interpretowane ostrożnie i z uwzględnieniem stanu klinicznego pacjenta, pamiętając, że możliwy jest brak korelacji między uzyskanymi wynikami a rzeczywistym stanem zmian zapalnych w płucach. Full article

Wstęp: Pyłowe zanieczyszczenia powietrza stanowią istotny czynnik wpływający na przebieg chorób układu oddechowego oraz sercowo-naczyniowego. Dwiema głównymi grupami tych zanieczyszczeń poddanymi monitorowaniu są zanieczyszczenia pyłowe o średnicy aerodynamicznej poniżej 10 μm (PM10) i 2.5 μm (PM2.5). Wśród chorób układu oddechowego duże znaczenia ma przewlekła obturacyjna choroba płuc (POChP). Jej manifestacja kliniczna oraz manifestacja kliniczna chorób układu sercowo- -naczyniowego są podobne i może to stanowić utrudnienie w trakcie wyboru terapii. W pracy badano związek pomiędzy pyłowymi zanieczyszczeniami powietrza oraz zaostrzenia POChP w populacji w której wykluczono sercowo-naczyniowe tło dolegliwości. Materiał i metody: Analizę oparto na danych dotyczących hospitalizacji na obszarze aglomeracji górnośląskiej w latach 2006–2016. Dane zostały skorelowane z danymi dotyczącymi warunków meteorologicznych i stężeniami zanieczyszczeń pyłowych do 90 dni przed dniem hospitalizacji. Wyniki: W trakcie całego badanego okresu nie zaobserwowano związku między PM10 oraz zaostrzeniami POChP. Wpływ PM2.5 stawał się istotny od 14 dnia przed przyjęciem do szpitala (RR 1.06) i wzrastał aż do maksymalnego badanego okresu 90 dni (RR 1.32). Wnioski: Praca podkreśla istotność wpływu pyłowych zanieczyszczeń powietrza na zaostrzenia POChP w długie perspektywie czasowej. Full article

Wstęp: Wysięk do worka osierdziowego o etiologii nowotworowej (NPE) stanowi częstą przyczynę zachorowalności i umieralności u chorych onkologicznych. Często przebiega w postaci tamponady serca wymagającej pilnego odbarczenia: perikardiocentezy lub perikardiotomii wraz z drenażem płynu. Pomimo dużej skuteczności tych zabiegów, nawrót płynu w osierdziu występuje u 30–60% pacjentów. Cisplatyna podawana doosierdziowo jest skuteczną i uznaną metodą przeciwdziałania ponownemu gromadzeniu się płynu w osierdziu w przebiegu raka płuc i raka piersi. Natomiast jej efektywność w leczeniu tamponady serca u chorych na raka nerki pozostaje nieznana. Opis przypadku: Przedstawiono przypadek 82-letniego mężczyzny chorego na raka nerki, który został przyjęty na oddział intensywnej terapii z powodu zagrażającej tamponady serca. W trybie pilnym wykonano zabieg perikardiotomii podmostkowej i ewakuowano z osierdzia 1000 ml krwistego płynu. Na wewnętrznej powierzchni osierdzia zauważono kilka różowych guzków, które pobrano do badania histopatologicznego, gdzie stwierdzono komórki raka jasnokomórkowego nerki. W związku z utrzymującymi się dużymi drenażami z osierdzia zdecydowano o konieczności zastosowania cisplatyny doosierdziowo. Ponadto już w pierwszej dobie po zabiegu chory otrzymał kolchicynę doustnie w dawce 0,5 mg dziennie. Nie zaobserwowano skutków niepożądanych terapii. Pacjent zmarł po 12 miesiącach z powodu progresji nowotworu i wyniszczenia. Nie odnotowano nawrotu wysięku do worka osierdziowego. Wnioski: Jest to pierwszy opis przypadku prezentujący długotrwałą skuteczność w prewencji nawrotu płynu w osierdziu po doosierdziowym podaniu cisplatny w połączeniu z doustną kolchicyną w leczeniu NPE w przebiegu jasnokomórkowego raka nerki z przerzutami. Full article

Immunoterapia z zastosowaniem leków blokujących punkty kontrolne zdaje się rewolucjonizować leczenie nowotworów litych, w tym raka płuca. Blokery szlaku PD-1, PD-L1 wykazały skuteczność w zakresie długotrwałego przeżycia w zaawansowanym raku płuca z przerzutami. U indywidualnych chorych osiąga się kilkuletnie przeżycia. W leczeniu raka płuca zarejestrowano nivolumab, pembrolizumab i atezolizumab. Obserwacje z praktyki klinicznej wskazują na podobną skuteczność tych leków, jak w próbach klinicznych. Efekty leczenia zależą od stanu sprawności. Wiek, płeć, typ histologiczny, obecność przerzutów do mózgu nie wpływały na wyniki leczenia. Leczenie antagonistami punktów kontrolnych jest bezpieczne i dobrze tolerowane, działania niepożądane wiążą się z zapaleniami o podłożu autoimmunizacyjnym. Poważnym i niekiedy śmiertelnym powikłaniem może być zapalenie pęcherzyków płucnych (pneumonitis), choć zazwyczaj poddaje się leczeniu glikokortykosteroidami. W celu odpowiedniej kwalifikacji chorych do leczenia ocenia się ekspresję PD-L1 na komórkach raka. Tak zwane guzy “gorące”, ze znaczną ekspresją PD-L1 i bogatym naciekiem z limfocytów cytotoksycznych zdają się lepiej odpowiadać na immunoterapię niż guzy “zimne”. Full article

Choroba zarostowa żył płucnych (PVOD) i hemangiomatoza włośniczek płucnych (PCH) należą do rzadkich schorzeń—szacowana częstość występowania wynosi mniej niż jeden przypadek na milion mieszkańców. W PVOD/PCH patologia dotyczy małych żyłek—przedprzegrodowych i przegrodowych, włośniczek oraz tętniczek zaprzegrodowych i małych tętniczek płucnych. W klasyfikacji nadciśnienia płucnego (PH) według ERS/ESC z 2015 roku PVOD/PCH tworzy podgrupę 1’. Dane z niedawnych analiz wskazują jednak, że PVOD/PCH może być w rzeczywistości częstsze, z powodu błędnej kwalifikacji tych chorych do grupy 1. Problem ten może dotyczyć przypadków rozpoznanych jako tętnicze nadciśnienie płucne (PAH) występujące w przebiegu twardziny, spowodowane lekami, związane z zakażeniem wirusem HIV oraz około 10% pacjentów z idiopatycznym PAH (IPAH). Ostatnio zidentyfikowano dwuallelowe mutacje genu EIF2AK4 w dziedzicznej postaci PVOD/PCH i w 9% przypadków bez rodzinnego występowania choroby. Udowodniono ponadto zależność między zawodowym narażeniem na rozpuszczalniki organiczne a PVOD/PCH. Niniejszy przegląd jest próbą podsumowania aktualnych danych na temat patogenezy, czynników ryzyka, cech klinicznych i algorytmu diagnostycznego PVOD/PCH. Full article

Pylica krzemowa, jako choroba zawodowa podlegająca profilaktyce, jest związana z licznymi chorobami, między innymi gruźlicą płuc. Ryzyko rozwoju gruźlicy istnieje przez całe życie nawet po przerwaniu narażenia na pył krzemionki. Związek tych dwóch schorzeń w znaczący sposób przyczynia się do bardzo wysokiego poziomu zachorowań na gruźlicę w krajach z niedostateczną kontrolą gruźlicy i narażenia na pył. W pracy przedstawiono przypadek mężczyzny z wcześniej rozpoznaną pylicą krzemową, u którego zdiagnozowano i leczono gruźlicę płuc. Leczenie przeciwprątkowe zostało przedłużone ze względu na dodatni rozmaz plwociny w 6. miesiącu leczenia. Hodowla dodatniej próbki była jednak ujemna. Przypadek ten podkreśla rolę starannego badania przesiewowego w kierunku gruźlicy u chorych z pylicą. Postępowanie kliniczne u tych chorych może być trudniejsze ze względu na często występujące trudne w różnicowaniu zmiany radiologiczne oraz niepewne wyniki leczenia. Full article

Wstęp: W powiecie proszowickim zarówno rak płuca, jak przewlekła obturacyjna choroba płuc (POChP), występują częściej w porównaniu z innymi regionami Polski. W prezentowanej pracy przedstawiono raport z programu prewencji, którego celem było zmniejszenie obciążeń zdrowotnych związanych z POChP i rakiem płuca w tym regionie. Materiał i metody: Program składał się z prewencji czynnej, opartej na badaniu kwestionariuszowym (w którym udział proponowano wszystkim mieszkańcom powiatu w wieku ≥ 40 lat) oraz na zdjęciu klatki piersiowej i spirometrii (które wykonywano u wybranych badanych), i prewencji biernej, na którą składały się liczne aktywności edukacyjne promujące zdrowy styl życia. Dane uzyskane w badaniu kwestionariuszowym i spirometrii były przedmiotem dalszej analizy. Wyniki: Programem edukacyjnym objęto wszystkie dzieci w wieku 13–15 lat, większość młodzieży i znaczną część dorosłych mieszkańców powiatu. Dane kwestionariuszowe uzyskano od 14,455 uczestników (około 70% mieszkańców powiatu). Na podstawie analizy tych danych wybrano kandydatów do badań spirometrycznego (5816 uczestników) i radiologicznego (5514 uczestników). Aktywni palacze stanowili 24.2% wszystkich uczestników (33.3% mężczyzn i 16.8% kobiet). Papierosów elektronicznych używało 0.65% uczestników. Stwierdzono negatywny wpływ narażeń zawodowych (w tym związanych z pracą w rolnictwie) na wyniki badania spirometrycznego i występowanie objawów ze strony układu oddechowego. Na podstawie wyniku spirometrii po leku rozkurczającym oskrzela u 13.2% uczestników rozpoznano POChP. Astmę rozpoznaną przez lekarza podawało w wywiadzie 7.2% badanych. Wnioski: Zgodnie z założeniami, program edukacyjny i badanie kwestionariuszowe przeprowadzono u większości mieszkańców powiatu. Badanie dostarczyło danych na temat występowania POChP, astmy i objawów ze strony układu oddechowego w powiecie proszowickim. Full article

Dietylokarbamazyna w leczeniu eozynofilowego zapalenia płuc wywołanego infestacją pasożytem (tropical pulmonary eosinofilia) przynosi poprawę tylko u części pacjentów, a w przypadku fazy przewlekłej schorzenia leczenie jest nieskuteczne u 20–40% chorych. W tych przypadkach stosuje się kortykosteroidy, choć skuteczność tego postępowania nie została dotychczas potwierdzona. U opisywanej pacjentki po trzech tygodniach standardowego leczenia dietylokarbamazyną odnotowano jedynie częściową odpowiedź kliniczną, hematologiczną i fizjologiczną. Do dwóch kolejnych cykli leczenia dołączono kortykosteroid, co przyczyniło się do całkowitego wyleczenia. Dwa miesiące później doszło jednak do wznowy choroby, przy czym stwierdzono wykładniki fazy przewlekłej schorzenia, ale kontynuacja leczenia kortykosteroidem przyniosła zadowalającą odpowiedź kliniczną. Full article

Elektroniczne papierosy są coraz częściej używanym sposobem dostarczania nikotyny. Sięgają po nie zarówno użytkownicy papierosów tradycyjnych, jak i osoby do tej pory niepalące. Cały czas pojawiają się nowe artykuły traktujące o potencjalnym wpływie elektronicznych systemów dostarczających nikotynę na zdrowie. Szczególne obawy budzi toksyczność związków chemicznych i pierwiastków dostarczanych wraz z dymem z tych urządzeń. Okazuje się, że produkty, których kreowany medialnie wizerunek jest pozytywny, wcale takimi nie są. Co więcej, ich używanie może skutkować nie tylko uszczerbkiem dla zdrowia, ale i śmiercią. Full article

Wstęp: Mukowiscydoza jest genetycznie uwarunkowaną wielonarządową chorobą, która negatywnie wpływa na długość życia. Chorzy na mukowiscydozę wymagają częstych hospitalizacji. W prezentowanej pracy podjęto próbę oceny trendów dotyczących hospitalizacji chorych na mukowiscydozę, występowania chorób współistniejących, wyników leczenia i zaleceń w chwili wypisu ze szpitala. Materiał i metody: Użyto danych krajowego rejestru hospitalizacji (National Inpatient Sample) w celu identyfikacji wszystkich przypadków oraz cech demograficznych chorych na mukowiscydozę hospitalizowanych w okresie 2003–2013. Oceniono występowanie współchorobowości, takich jak ostre uszkodzenie nerek (AKI, acute kidney injury) oraz ich wpływ na przebieg choroby. Dokonano szczegółowej analizy podgrupy chorych po przeszczepieniu płuca. Wyniki: Roczna częstość hospitalizacji na 1000 chorych na mukowiscydozę w Stanach Zjednoczonych wzrosła z 994 w 2003 roku do 1072 w roku 2013. Ogólna śmiertelność wewnątrzszpitalna wynosiła 1.5%, a mediana wieku w chwili zgonu—27 lat. Śmiertelność wewnątrzszpitalna wykazywała trend spadkowy z 1.9% w roku 2003 do 1.2% w 2013 roku (wartość p dla trendu: 0.002). Mediana długości pobytu w szpitalu wynosiła 7 dni. Przewlekła choroba wątroby i ostre uszkodzenie nerek występowały odpowiednio z częstością 3.7% i 3.8%. Wieloczynnikowy skorygowany iloraz szans dla śmiertelności w AKI wynosił 1.74 (95% CI 1.57−1.93, p < 0.001). Pacjenci po przebytej transplantacji płuca stanowili 6.5% wszystkich hospitalizacji. U tych chorych stwierdzono znamiennie wyższe ryzyko rozwoju ostrego uszkodzenia nerek. Wnioski: Wskaźniki rocznej hospitalizacji chorych na mukowiscydozę rosną z każdym rokiem. Kobiety stanowią większość chorych hospitalizowanych, pomimo przewagi mężczyzn w populacji wszystkich chorych na mukowiscydozę. Występowanie AKI wiąże się z większą śmiertelnością podczas hospitalizacji. Full article