Content-Type: text/html; charset=ISO-8859-1 PlantCARE Webmaster Firefox specific output
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REFERENCE:PlantCARE: a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences.
Lescot, M., Déhais, P., Moreau, Y., De Moor, B., Rouzé ,P.,and Rombauts, S.
Nucleic Acids Res., Database issue(2002), 30(1):325-327.

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


+ CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


- TTAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CAATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA


Motifs Found
    
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
organism 1354 - 4 motif_sequence short_function
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>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


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+ TAATA
TAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


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+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


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- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CA
ATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CG
CCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    3-AF1 binding site
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
3-AF1 binding site Solanum tuberosum 146 + 10 TAAGAGAGGAA light responsive element

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


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+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


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+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


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+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


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- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


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- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


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- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CAATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    AAGAA-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
AAGAA-motif Avena sativa 1388 + 9 gGTAAAGAAA

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


+ CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


- TTAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CAATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    ABRE
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
ABRE Arabidopsis thaliana 415 - 5 ACGTG cis-acting element involved in the abscisic acid responsiveness
ABRE Arabidopsis thaliana 868 - 5 ACGTG cis-acting element involved in the abscisic acid responsiveness

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


+ CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCA


- TTAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CAATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    ARE
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
ARE Zea mays 1408 - 6 AAACCA cis-acting regulatory element essential for the anaerobic induction

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


+ CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


- TTAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CAATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    AT~TATA-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
AT~TATA-box Arabidopsis thaliana 540 + 6 TATATA
AT~TATA-box Arabidopsis thaliana 444 + 6 TATATA

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


+ CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


- TTAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CAATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    Box 4
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Box 4 Petroselinum crispum 719 + 6 ATTAAT part of a conserved DNA module involved in light responsiveness
Box 4 Petroselinum crispum 435 + 6 ATTAAT part of a conserved DNA module involved in light responsiveness

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


+ CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


- TTAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CAATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    CAAT-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
CAAT-box Pisum sativum 810 - 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Nicotiana glutinosa 626 + 4 CAAT
CAAT-box Pisum sativum 844 - 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Pisum sativum 590 + 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Arabidopsis thaliana 485 + 5 CCAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Arabidopsis thaliana 682 + 5 CCAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Nicotiana glutinosa 683 + 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 420 + 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 1261 + 4 CAAT
CAAT-box Pisum sativum 409 - 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Arabidopsis thaliana 1260 + 5 CCAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Nicotiana glutinosa 635 - 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 1177 - 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 1157 - 4 CAAT
CAAT-box Pisum sativum 977 - 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Nicotiana glutinosa 708 + 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 546 + 4 CAAT
CAAT-box Pisum sativum 655 - 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Pisum sativum 731 - 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Pisum sativum 83 + 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Pisum sativum 397 - 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Nicotiana glutinosa 486 + 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 389 + 4 CAAT

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAA
TATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATA


+ TGT
TGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAAT


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


- TTAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CAATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    CGTCA-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
CGTCA-motif Hordeum vulgare 417 + 5 CGTCA cis-acting regulatory element involved in the MeJA-responsiveness
CGTCA-motif Hordeum vulgare 1191 + 5 CGTCA cis-acting regulatory element involved in the MeJA-responsiveness

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ A
ATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


+ CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


- TTAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CAATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    CTAG-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
CTAG-motif Avena sativa 170 + 9 ACTAGCAGAA

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


+ CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


- TTAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CAATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    ERE
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
ERE Nicotiana glutinos 743 - 8 ATTTTAAA

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


+ CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


- TTAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CAATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    G-Box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
G-Box Pisum sativum 868 + 6 CACGTT cis-acting regulatory element involved in light responsiveness

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


+ CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


- TTAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CAATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    G-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
G-box Brassica oleracea 868 - 8 TAAACGTG cis-acting regulatory element involved in light responsiveness
G-box Zea mays 192 + 6 CACGAC cis-acting regulatory element involved in light responsiveness
G-box Zea mays 415 + 6 CACGTC cis-acting regulatory element involved in light responsiveness

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


+ CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


- TTAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CAATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    GATA-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
GATA-motif Arabidopsis thaliana 859 - 7 GATAGGA part of a light responsive element
GATA-motif Arabidopsis thaliana 857 - 10 AAGATAAGATT part of a light responsive element

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


+ CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


- TTAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CAATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    GT1-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
GT1-motif Arabidopsis thaliana 310 - 6 GGTTAA light responsive element
GT1-motif Solanum tuberosum 1419 + 9 GTGTGTGAA light responsive element

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


+ CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


- TTAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CAATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    MYB
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
MYB Arabidopsis thaliana 32 - 6 CAACCA

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


+ CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


- TTAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CAATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    MYC
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
MYC Arabidopsis thaliana 730 + 6 CATTTG
MYC Arabidopsis thaliana 654 + 6 CATTTG
MYC Arabidopsis thaliana 976 + 6 CATTTG
MYC Arabidopsis thaliana 396 + 6 CATTTG
MYC Arabidopsis thaliana 83 - 6 CATTTG
MYC Arabidopsis thaliana 506 + 6 CATGTG

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ G
GTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


+ CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


- TTAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CAATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    Myc
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Myc Arabidopsis thaliana 146 - 7 TCTCTTA

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


+ CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


- TTAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CAATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    STRE
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
STRE Arabidopsis thaliana 1384 + 5 AGGGG
STRE Arabidopsis thaliana 1319 + 5 AGGGG
STRE Arabidopsis thaliana 965 - 5 AGGGG
STRE Arabidopsis thaliana 1039 + 5 AGGGG
STRE Arabidopsis thaliana 645 - 5 AGGGG
STRE Arabidopsis thaliana 122 + 5 AGGGG

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


+ CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


- TTAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CAATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    TATA-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TATA-box Arabidopsis thaliana 1333 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 594 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 489 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 952 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 775 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica oleracea 488 + 6 ATATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica oleracea 333 + 6 ATATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 334 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 443 - 7 TATATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 269 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Oryza sativa 1286 - 7 TACAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 405 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Pisum sativum 266 - 7 TATAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 494 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica oleracea 493 + 6 ATATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 774 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1332 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 601 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 595 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 444 + 6 TATATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 556 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica oleracea 466 + 6 ATATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 135 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 467 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Pisum sativum 772 - 7 TATAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 446 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica oleracea 445 + 6 ATATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 593 + 6 ATTATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 555 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 268 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Helianthus annuus 554 - 6 TATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica juncea 553 - 7 TATAAAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 771 - 9 ccTATAAAaa core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 406 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 540 + 6 TATATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 442 + 6 ATTATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 538 + 6 ATTATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Helianthus annuus 773 - 6 TATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Helianthus annuus 267 - 6 TATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Daucus carota 552 - 8 TATAAATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 542 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 539 - 7 TATATAA core promoter element around -30 of transcription start

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TA
ATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATA


+ TGT
TGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


+ CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCA


- TCTATA
AAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


- T
TAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CAATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    TCA
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TCA Pisum sativum 1352 - 9 TCATCTTCAT
TCA Pisum sativum 1139 + 9 TCATCTTCAT
TCA Pisum sativum 833 + 9 TCATCTTCAT

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTA
TTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


+ CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


- TTAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CAATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    TCA-element
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TCA-element Nicotiana tabacum 1261 + 9 CCATCTTTTT cis-acting element involved in salicylic acid responsiveness

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


- TTAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CAATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    TCCC-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TCCC-motif Spinacia oleracea 1457 - 7 TCTCCCT part of a light responsive element
TCCC-motif Spinacia oleracea 958 + 7 TCTCCCT part of a light responsive element
TCCC-motif Spinacia oleracea 1324 - 7 TCTCCCT part of a light responsive element

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


+ CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


- TTAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CA
ATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    TCT-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TCT-motif Arabidopsis thaliana 322 + 6 TCTTAC part of a light responsive element
TCT-motif Arabidopsis thaliana 145 - 6 TCTTAC part of a light responsive element

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


+ CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


- TTAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CAATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    TGACG-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TGACG-motif Hordeum vulgare 417 - 5 TGACG cis-acting regulatory element involved in the MeJA-responsiveness
TGACG-motif Hordeum vulgare 1191 - 5 TGACG cis-acting regulatory element involved in the MeJA-responsiveness

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


+ CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


- T
TAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CAATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    Unnamed__4
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Unnamed__4 Petroselinum hortense 1459 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 1416 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 1382 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 1344 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 1322 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 1098 + 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 963 + 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 1326 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 959 + 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 941 + 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 153 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 1209 + 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 576 - 4 CTCC

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


+ CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


- TTAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTC


- CAA
TATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    WRE3
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
WRE3 Pisum sativum 986 - 6 CCACCT
WRE3 Pisum sativum 572 - 6 CCACCT
WRE3 Pisum sativum 1017 - 6 CCACCT

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


+ CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


- TTAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


- GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CAATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    as-1
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
as-1 Arabidopsis thaliana 417 - 5 TGACG
as-1 Arabidopsis thaliana 1191 - 5 TGACG

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


+ CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


+ GTTATAGAGG TTTGGAGAGA GAAGAAGATG AAAGAGAGTG GGGAAGAACG AGGAGGGGGA AAAGAAAGAT 


+ ACTTTCATGG TTTAGGGAGT GTGTGAAAGT TTGAGAAGGT GTTGGGTGAG AGTGAGAGGG AGAGAGTGTT 


+ GCGGCAGCTA TGGGTGGATC TGGGTTCTT
- AAAGTCTACG AAGAGTGTCT ATAAGTTTCA AACCAACTAA GTTGATAAGT TGTTCATCCT TTGATTAATC 


- GTGTTTCTTT TTGTTTACCC CCCAGACTTC TATAAAACCC TAATTTTATG CTCCCCACCT ACCCATATAC 


- ATTACATTCT CTCCTCCTTC CATCGTACGT CATCGTCTTC GCTATTTTTT TGTGCTGTCA CTTTTCCTTG 


- TGCTTCTGCT GAACCTTATG CCAACCCTTC CCTTATACTC ACAATGTAGC GTACAAAAAT ATGTCACCAC 


- TCTATAAAAT AAAAATTCAA TAATTGAAAA ATTGGGTGTA TAGAATGGTC ATTATATTAC TATGCATCAC 


- ATGATAGAGT ATACAGCCAG TGTAATTTTT TTTAAAGAGT TAATAGTAAA CTACAATATA AACTGTGCAG 


- T
TAAGCAGAG AAACTAATTA TTAATATATT TAATAAATAG TGTAGTATAT TATGTGACAT GTGTGGTTAT 


- ATTATATTTG TATTTGTACA CTAAAAGGAC TATAATGATA CTTACTTTAA TATATGTTAT AATAAATATT 


- ACAACAGGAG TTCCACCTCT AAAGCTCAAG TTTAATATGT ATATGTTCTC TAAGTACGTT CATAAGTTAT 


- AATTTAACAC TAGTGGGGAA TTAGTAAACA CTTTTTCTTT TTCAATTGAA CGGTTAGAGT AAGGAGAATT 


- ATTAATTGTT AAATCGAATA ATTACGATAG TAAACAATTT TTAAATTTTA TACTCTTGAA AATACTATGA 


- AAAAATATCT TCAATTATCA TAGAGCAAAA TTATTTTAAT AAACGCCTGC AATACATCAA TGAGTAGTAG 


- TAATAAACGT AAGCCTTTAG GATAGAAGTG CAAATTGCTA AAATGTTGTA CTACATACTT AATCTTCTTT 


- TTATTACAAT AATGCGTTCT TAAGAAGAGA GAGGTTTGGA GATATTGAGA GGGAGGGGAG AGAAAGTAAA 


- CCACGTCCAC CACCGCGCTT CTACAGGAAA ATCGTCTCCA CCCCACCGAT TTTCTTTATC CCCATGACGC 


- AAAACCTAAG ACCCAACACT CAAGACCCAA GATTTAAATA AGCAATTGAG GTCGAAGAGC AGGATGAAGC 


- CCAAGTCTAG AACGACAAAG CAGAAGTAGG AGACAGTAAC GGACAGTTTC AGCTGCTAAC GCAACCAGGA 


GCAGTCCAAG TCTAGAGTGA GGAGTAAAAG GGAAGCCTAA GGATAAAAAA GTTGAAAGAC TTTAAATACG 


- GTTAGAAAAA GCTATAAAAA GACCCAAAAC ATACTTGTAT ACACCCAACT TCAACTTCTC CCCTCCCTCT 


- CAATATCTCC AAACCTCTCT CTTCTTCTAC TTTCTCTCAC CCCTTCTTGC TCCTCCCCCT TTTCTTTCTA 


- TGAAAGTACC AAATCCCTCA CACACTTTCA AACTCTTCCA CAACCCACTC TCACTCTCCC TCTCTCACAA 


- CGCCGTCGAT ACCCACCTAG ACCCAAGAA
    box S
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
box S Arabidopsis thaliana 1023 - 7 AGCCACC

>037815
+ TTTCAGATGC TTCTCACAGA TATTCAAAGT TTGGTTGATT CAACTATTCA ACAAGTAGGA AACTAATTAG 


+ CACAAAGAAA AACAAATGGG GGGTCTGAAG ATATTTTGGG ATTAAAATAC GAGGGGTGGA TGGGTATATG 


+ TAATGTAAGA GAGGAGGAAG GTAGCATGCA GTAGCAGAAG CGATAAAAAA ACACGACAGT GAAAAGGAAC 


+ ACGAAGACGA CTTGGAATAC GGTTGGGAAG GGAATATGAG TGTTACATCG CATGTTTTTA TACAGTGGTG 


+ AGATATTTTA TTTTTAAGTT ATTAACTTTT TAACCCACAT ATCTTACCAG TAATATAATG ATACGTAGTG 


+ TACTATCTCA TATGTCGGTC ACATTAAAAA AAATTTCTCA ATTATCATTT GATGTTATAT TTGACACGTC 


+ AATTCGTCTC TTTGATTAAT AATTATATAA ATTATTTATC ACATCATATA ATACACTGTA CACACCAATA 


+ TAATATAAAC ATAAACATGT GATTTTCCTG ATATTACTAT GAATGAAATT ATATACAATA TTATTTATAA 


+ TGTTGTCCTC AAGGTGGAGA TTTCGAGTTC AAATTATACA TATACAAGAG ATTCATGCAA GTATTCAATA 


+ TTAAATTGTG ATCACCCCTT AATCATTTGT GAAAAAGAAA AAGTTAACTT GCCAATCTCA TTCCTCTTAA 


+ TAATTAACAA TTTAGCTTAT TAATGCTATC ATTTGTTAAA AATTTAAAAT ATGAGAACTT TTATGATACT 


+ TTTTTATAGA AGTTAATAGT ATCTCGTTTT AATAAAATTA TTTGCGGACG TTATGTAGTT ACTCATCATC 


+ ATTATTTGCA TTCGGAAATC CTATCTTCAC GTTTAACGAT TTTACAACAT GATGTATGAA TTAGAAGAAA 


+ AATAATGTTA TTACGCAAGA ATTCTTCTCT CTCCAAACCT CTATAACTCT CCCTCCCCTC TCTTTCATTT 


+ GGTGCAGGTG GTGGCGCGAA GATGTCCTTT TAGCAGAGGT GGGGTGGCTA AAAGAAATAG GGGTACTGCG 


+ TTTTGGATTC TGGGTTGTGA GTTCTGGGTT CTAAATTTAT TCGTTAACTC CAGCTTCTCG TCCTACTTCG 


+ GGTTCAGATC TTGCTGTTTC GTCTTCATCC TCTGTCATTG CCTGTCAAAG TCGACGATTG CGTTGGTCCT 


+ CGTCAGGTTC AGATCTCACT CCTCATTTTC CCTTCGGATT CCTATTTTTT CAACTTTCTG AAATTTATGC 


+ CAATCTTTTT CGATATTTTT CTGGGTTTTG TATGAACATA TGTGGGTTGA AGTTGAAGAG GGGAGGGAGA 


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