Content-Type: text/html; charset=ISO-8859-1 PlantCARE Webmaster Firefox specific output
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REFERENCE:PlantCARE: a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences.
Lescot, M., Déhais, P., Moreau, Y., De Moor, B., Rouzé ,P.,and Rombauts, S.
Nucleic Acids Res., Database issue(2002), 30(1):325-327.

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA


Motifs Found
    
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
organism 525 - 4 motif_sequence short_function
organism 101 - 4 motif_sequence short_function
organism 350 - 4 motif_sequence short_function
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organism 111 - 4 motif_sequence short_function

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA T
GTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


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+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


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+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


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+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    AE-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
AE-box Arabidopsis thaliana 704 + 8 AGAAACAA part of a module for light response

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    ARE
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
ARE Zea mays 325 + 6 AAACCA cis-acting regulatory element essential for the anaerobic induction

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    AT~TATA-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
AT~TATA-box Arabidopsis thaliana 582 + 6 TATATA
AT~TATA-box Arabidopsis thaliana 366 + 6 TATATA

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    Box 4
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Box 4 Petroselinum crispum 1187 - 6 ATTAAT part of a conserved DNA module involved in light responsiveness

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TA
TATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    CAAT-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
CAAT-box Nicotiana glutinosa 1478 + 4 CAAT
CAAT-box Arabidopsis thaliana 1411 - 5 CCAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Nicotiana glutinosa 1434 + 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 1387 + 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 1396 + 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 1005 - 4 CAAT
CAAT-box Pisum sativum 1087 - 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Pisum sativum 975 - 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Nicotiana glutinosa 1003 + 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 1168 + 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 1357 - 4 CAAT
CAAT-box Pisum sativum 955 - 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Nicotiana glutinosa 320 + 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 753 + 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 716 + 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 692 - 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 648 - 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 668 - 4 CAAT
CAAT-box Arabidopsis thaliana 166 - 5 CCAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Pisum sativum 406 - 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Nicotiana glutinosa 400 - 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 571 - 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 298 + 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 629 - 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 334 + 4 CAAT

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACAT


+ TAC
ATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAAT


+ TTA
AAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTA


- TAT
ACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    CGTCA-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
CGTCA-motif Hordeum vulgare 1065 + 5 CGTCA cis-acting regulatory element involved in the MeJA-responsiveness

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    DRE
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
DRE Arabidopsis thaliana 894 - 9 TACCGACAT "cis-acting element involved in dehydration, low-temp, salt stresses

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    DRE1
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
DRE1 Zea mays 1420 + 7 ACCGAGA

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    ERE
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
ERE Nicotiana glutinos 1398 + 8 ATTTTAAA
ERE Nicotiana glutinos 1105 + 8 ATTTTAAA
ERE Nicotiana glutinos 1400 - 8 ATTTTAAA
ERE Nicotiana glutinos 412 - 8 ATTTCATA
ERE Nicotiana glutinos 870 + 8 ATTTTAAA

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAA
ATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- T
ATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTA


- AATTTTA
GAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    G-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
G-box Zea mays 170 - 6 CACGAC cis-acting regulatory element involved in light responsiveness

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    LTR
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
LTR Hordeum vulgare 1324 - 6 CCGAAA cis-acting element involved in low-temperature responsiveness

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCC


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    MBS
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
MBS Arabidopsis thaliana 38 - 6 CAACTG MYB binding site involved in drought-inducibility

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    MYB
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
MYB Arabidopsis thaliana 1347 + 6 CAACAG
MYB Arabidopsis thaliana 901 + 6 TAACCA
MYB Arabidopsis thaliana 1221 + 6 CAACCA
MYB Arabidopsis thaliana 432 - 6 TAACCA
MYB Arabidopsis thaliana 487 - 6 CAACCA

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- AC
CCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    MYB-like sequence
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
MYB-like sequence Arabidopsis thaliana 432 - 6 TAACCA
MYB-like sequence Arabidopsis thaliana 901 + 6 TAACCA

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    MYC
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
MYC Arabidopsis thaliana 1003 - 6 CAATTG

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    Myb
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Myb Arabidopsis thaliana 597 + 6 TAACTG
Myb Arabidopsis thaliana 38 - 6 CAACTG

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    Myb-binding site
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Myb-binding site Nicotiana tabacum 1347 + 6 CAACAG

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    P-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
P-box Oryza sativa 470 - 7 CCTTTTG gibberellin-responsive element

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    TATA
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TATA Arabidopsis thaliana 674 + 8 TATAAAAT

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    TATA-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TATA-box Arabidopsis thaliana 1267 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1192 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1162 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1161 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 581 - 7 TATATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 664 + 6 ATATAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1015 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 591 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1118 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Oryza sativa 1144 - 8 TACATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 1160 + 6 ATTATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1014 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Helianthus annuus 1013 - 6 TATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 582 + 6 TATATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 580 + 6 ATTATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 420 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 665 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica oleracea 590 + 6 ATATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 584 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica oleracea 583 + 6 ATATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 674 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 672 + 6 ATTATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Pisum sativum 1012 - 7 TATAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 673 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 368 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Oryza sativa 391 - 8 TACATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 418 + 6 ATTATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 419 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 367 + 6 ATATAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 366 + 6 TATATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 343 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 82 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 365 - 7 TATATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 342 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 341 + 6 ATTATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 338 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 337 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 336 + 6 ATTATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 83 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 46 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Helianthus annuus 81 - 6 TATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Helianthus annuus 44 - 6 TATACA core promoter element around -30 of transcription start

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATGATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TA
TACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    TCT-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TCT-motif Arabidopsis thaliana 800 - 6 TCTTAC part of a light responsive element

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    TGACG-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TGACG-motif Hordeum vulgare 1065 - 5 TGACG cis-acting regulatory element involved in the MeJA-responsiveness

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    Unnamed__1
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Unnamed__1 Zea mays 172 + 5 CGTGG
Unnamed__1 Zea mays 307 + 5 CGTGG

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    Unnamed__4
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Unnamed__4 Petroselinum hortense 516 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 312 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 111 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 64 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 68 - 4 CTCC

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCC


- CCA
CCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    Unnamed__6
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Unnamed__6 Zea mays 591 + 10 taTAAATATct

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    WRE3
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
WRE3 Pisum sativum 834 - 6 CCACCT
WRE3 Pisum sativum 534 - 6 CCACCT
WRE3 Pisum sativum 70 - 6 CCACCT
WRE3 Pisum sativum 511 - 6 CCACCT

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACC


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    as-1
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
as-1 Arabidopsis thaliana 1065 - 5 TGACG

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


- TATATGGGAA TTATAATCCT AAAGACTGTT GTTGGTTTTG TGTTGGAAAT TTGATGGAAT TTTACTCCTT 


- TATTAGATAT AGTGAAAAAT CAAAAGTAAT AAGAGAAGTT GAAAACTTGA TGAAAGACGT TGGAAAGCCT 


- AAAAACGTTT TGCTATGTTG TCGGAATAAC AATGGAAACT GACGTGAAAG TAAGAAGTTA GTGTAGTTAA 


- AATTTTAGAA TAACCTTCAT GGCTCTATGG ATCGTTAAAT TAGAGCTTCT GAAACAAAAA AAATAAGAAA 


- AAACAAAGTT AAGTCCGAAA GTAATACCA
    chs-CMA1a
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
chs-CMA1a Daucus carota 796 - 8 TTACTTAA part of a light responsive element

>006277
+ TGATGAATAA AACAGAATGA TAATTAACAA ACAGAAACAG TTGTGTATAA TTTAAAAATG AATGGAGGGA 


+ GGTGGTGGTG TTTATAAGCG TTGTAAAAAT GCAGAGGTGA GGAGAGTGAT GAGTGAGTTT TGTTTTCTTC 


+ TATTCTTTTT GTGAAAAGAG AGTGAATTGG TCGTGGAACG CGGTTTGTTC GGAATCTCAG GGAAAAGACA 


+ TGTACGCGGA ACGCAGCATT AGACAGAGAA AAAAGAGAGA AGCAGACAAA GCCTTGTATT CAGAGAAGGA 


+ AGAAAGCTAA AAGTACTCAA TTATCTCGTG GGGAGCATAC AATAAAACCA CCACAATTAT ATTATACATG 


+ TACATATTTA TGTGTTATAT ATGTACGTTT ATTTATTTAT TTTATGTAAA TTGATATTTG TTATGAAATT 


+ ATATGCGGAT GTGGTTACGG TTTGTTTGAA TGTGTTACAC GCAAGGATTC AAAAGGTGCT AGGCACTGGT 


+ TGGGCGACGG ATATGTGTCT AGGTGGGAGT TTAGGCAGAG CCTAGGTGGG GGTTTAGGCA GTTTTTTTTT 


+ TTTAATTTTA ATTGAATTTA TTATATAACA TATAAATAAC TGCCTACTTG TACTTAAAAA AATACATCAT 


+ TGTATTAAAA CGCTTGAATT GCAAAATAGA ATGATATATT GATTATAAAA TATTCAAACA TATTGAAAAT 


+ ATGAGAAACA ACATACAATG AGTGCTCATC CAAACATTCA AGAAATCTCG TACAATTTAA TGAAAAAATA 


+ AAATGCAAGA TGGAAGTTAT CTTTCTTAAG TAAGAATTTC GACCTAAGTG GGTGGACAGG TCTAGGTGGG 


+ CGCCTAGGTA GGCTAGGTGC CCTTTCTTAA TTTTAAATGC TTAGGGACTA ATCATGTCGG TAACCAGCCG 


+ CCTAGCACTA GGCAGAGATT TTTAGAACAC TAGTTACATG CATTATTTGT AATGGTGACT TATTATTTGA 


+ ATGTCAAGCT TTTATGCATT ATCAATTGTG TTTTTATATC CCGCAAACTG AGAATTTAGC TTGAGTAGTT 


+ ATTTTAGTTT TATTCGTCAT CTAACAGTGT TGAGAAATTT GGAAAAATAA CTAAATTTTA AATCCCGTAT 


+ AGAATGTTAA CGATCATTTT AATTTTATGT AATTATGTAA TTATAATCAA TACTTGATGT AAAAGTATTA 


+ ATATACCCTT AATATTAGGA TTTCTGACAA CAACCAAAAC ACAACCTTTA AACTACCTTA AAATGAGGAA 


+ ATAATCTATA TCACTTTTTA GTTTTCATTA TTCTCTTCAA CTTTTGAACT ACTTTCTGCA ACCTTTCGGA 


+ TTTTTGCAAA ACGATACAAC AGCCTTATTG TTACCTTTGA CTGCACTTTC ATTCTTCAAT CACATCAATT 


+ TTAAAATCTT ATTGGAAGTA CCGAGATACC TAGCAATTTA ATCTCGAAGA CTTTGTTTTT TTTATTCTTT 


+ TTTGTTTCAA TTCAGGCTTT CATTATGGT
- ACTACTTATT TTGTCTTACT ATTAATTGTT TGTCTTTGTC AACACATATT AAATTTTTAC TTACCTCCCT 


- CCACCACCAC AAATATTCGC AACATTTTTA CGTCTCCACT CCTCTCACTA CTCACTCAAA ACAAAAGAAG 


- ATAAGAAAAA CACTTTTCTC TCACTTAACC AGCACCTTGC GCCAAACAAG CCTTAGAGTC CCTTTTCTGT 


- ACATGCGCCT TGCGTCGTAA TCTGTCTCTT TTTTCTCTCT TCGTCTGTTT CGGAACATAA GTCTCTTCCT 


- TCTTTCGATT TTCATGAGTT AATAGAGCAC CCCTCGTATG TTATTTTGGT GGTGTTAATA TAATATGTAC 


- ATGTATAAAT ACACAATATA TACATGCAAA TAAATAAATA AAATACATTT AACTATAAAC AATACTTTAA 


- TATACGCCTA CACCAATGCC AAACAAACTT ACACAATGTG CGTTCCTAAG TTTTCCACGA TCCGTGACCA 


- ACCCGCTGCC TATACACAGA TCCACCCTCA AATCCGTCTC GGATCCACCC CCAAATCCGT CAAAAAAAAA 


- AAATTAAAAT TAACTTAAAT AATATATTGT ATATTTATTG ACGGATGAAC ATGAATTTTT TTATGTAGTA 


- ACATAATTTT GCGAACTTAA CGTTTTATCT TACTATATAA CTAATATTTT ATAAGTTTGT ATAACTTTTA 


- TACTCTTTGT TGTATGTTAC TCACGAGTAG GTTTGTAAGT TCTTTAGAGC ATGTTAAATT ACTTTTTTAT 


- TTTACGTTCT ACCTTCAATA GAAAGAATTC ATTCTTAAAG CTGGATTCAC CCACCTGTCC AGATCCACCC 


- GCGGATCCAT CCGATCCACG GGAAAGAATT AAAATTTACG AATCCCTGAT TAGTACAGCC ATTGGTCGGC 


- GGATCGTGAT CCGTCTCTAA AAATCTTGTG ATCAATGTAC GTAATAAACA TTACCACTGA ATAATAAACT 


- TACAGTTCGA AAATACGTAA TAGTTAACAC AAAAATATAG GGCGTTTGAC TCTTAAATCG AACTCATCAA 


- TAAAATCAAA ATAAGCAGTA GATTGTCACA ACTCTTTAAA CCTTTTTATT GATTTAAAAT TTAGGGCATA 


- TCTTACAATT GCTAGTAAAA TTAAAATACA TTAATACATT AATATTAGTT ATGAACTACA TTTTCATAAT 


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