Content-Type: text/html; charset=ISO-8859-1 PlantCARE Webmaster Firefox specific output
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REFERENCE:PlantCARE: a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences.
Lescot, M., Déhais, P., Moreau, Y., De Moor, B., Rouzé ,P.,and Rombauts, S.
Nucleic Acids Res., Database issue(2002), 30(1):325-327.
>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG


Motifs Found
    
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
organism 144 + 4 motif_sequence short_function
organism 946 - 4 motif_sequence short_function
organism 616 + 4 motif_sequence short_function
organism 1154 - 4 motif_sequence short_function
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organism 938 - 4 motif_sequence short_function
organism 624 + 4 motif_sequence short_function
organism 1233 - 4 motif_sequence short_function

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    AAGAA-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
AAGAA-motif Avena sativa 11 + 7 GAAAGAA

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    ABRE
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
ABRE Arabidopsis thaliana 522 + 5 ACGTG cis-acting element involved in the abscisic acid responsiveness
ABRE Arabidopsis thaliana 791 + 5 ACGTG cis-acting element involved in the abscisic acid responsiveness

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    ABRE3a
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
ABRE3a Zea mays 790 + 6 TACGTG

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    ABRE4
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
ABRE4 Zea mays 790 - 6 CACGTA

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    AE-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
AE-box Arabidopsis thaliana 675 - 8 AGAAACAA part of a module for light response

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    ATCT-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
ATCT-motif Pisum sativum 955 - 9 AATCTAATCC part of a conserved DNA module involved in light responsiveness

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    AT~TATA-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
AT~TATA-box Arabidopsis thaliana 508 + 6 TATATA
AT~TATA-box Arabidopsis thaliana 1242 - 6 TATATA
AT~TATA-box Arabidopsis thaliana 1159 - 6 TATATA
AT~TATA-box Arabidopsis thaliana 1254 - 6 TATATA
AT~TATA-box Arabidopsis thaliana 865 - 8 TATATAAA
AT~TATA-box Arabidopsis thaliana 1250 - 6 TATATA
AT~TATA-box Arabidopsis thaliana 1238 - 6 TATATA
AT~TATA-box Arabidopsis thaliana 1258 - 6 TATATA
AT~TATA-box Arabidopsis thaliana 800 - 6 TATATA
AT~TATA-box Arabidopsis thaliana 1246 - 6 TATATA
AT~TATA-box Arabidopsis thaliana 869 - 6 TATATA
AT~TATA-box Arabidopsis thaliana 1256 - 6 TATATA
AT~TATA-box Arabidopsis thaliana 867 - 6 TATATA
AT~TATA-box Arabidopsis thaliana 1252 - 6 TATATA
AT~TATA-box Arabidopsis thaliana 1240 - 6 TATATA
AT~TATA-box Arabidopsis thaliana 1244 - 6 TATATA
AT~TATA-box Arabidopsis thaliana 454 + 6 TATATA
AT~TATA-box Arabidopsis thaliana 1248 - 6 TATATA
AT~TATA-box Arabidopsis thaliana 802 - 6 TATATA

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    Box 4
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Box 4 Petroselinum crispum 291 + 6 ATTAAT part of a conserved DNA module involved in light responsiveness
Box 4 Petroselinum crispum 1146 - 6 ATTAAT part of a conserved DNA module involved in light responsiveness

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    CAAT-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
CAAT-box Nicotiana glutinosa 103 + 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 214 + 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 257 - 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 261 + 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 451 + 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 560 - 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 571 - 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 629 + 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 637 - 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 642 + 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 656 - 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 660 + 4 CAAT
CAAT-box Arabidopsis thaliana 739 + 5 CCAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Nicotiana glutinosa 740 + 4 CAAT
CAAT-box Pisum sativum 770 - 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Pisum sativum 841 + 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Pisum sativum 1032 + 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Pisum sativum 1112 - 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Nicotiana glutinosa 1133 + 4 CAAT
CAAT-box Nicotiana glutinosa 1180 + 4 CAAT
CAAT-box Arabidopsis thaliana 1264 - 5 CCAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Nicotiana glutinosa 1275 - 4 CAAT
CAAT-box Pisum sativum 1291 + 5 CAAAT common cis-acting element in promoter and enhancer regions
CAAT-box Nicotiana glutinosa 1375 - 4 CAAT

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    G-Box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
G-Box Pisum sativum 521 - 6 CACGTT cis-acting regulatory element involved in light responsiveness

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    G-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
G-box Arabidopsis thaliana 790 + 6 TACGTG cis-acting regulatory element involved in light responsiveness
G-box Zea mays 1359 + 6 CACGAC cis-acting regulatory element involved in light responsiveness
G-box Zea mays 1281 - 6 CACGAC cis-acting regulatory element involved in light responsiveness

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    GA-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
GA-motif Arabidopsis thaliana 752 - 8 ATAGATAA part of a light responsive element

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    GATA-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
GATA-motif Arabidopsis thaliana 1116 + 7 GATAGGA part of a light responsive element

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    GT1-motif
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
GT1-motif Avena sativa 644 - 7 GGTTAAT light responsive element
GT1-motif Arabidopsis thaliana 1099 + 6 GGTTAA light responsive element
GT1-motif Arabidopsis thaliana 645 - 6 GGTTAA light responsive element
GT1-motif Arabidopsis thaliana 1392 + 6 GGTTAA light responsive element

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    L-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
L-box Petroselinum crispum 1003 - 10 ATCCCACCTAC part of a light responsive element

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    MRE
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
MRE Petroselinum crispum 647 + 7 AACCTAA MYB binding site involved in light responsiveness
MRE Petroselinum crispum 1296 - 7 AACCTAA MYB binding site involved in light responsiveness

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    MYB
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
MYB Arabidopsis thaliana 127 + 6 TAACCA
MYB Arabidopsis thaliana 1098 - 6 TAACCA
MYB Arabidopsis thaliana 329 - 6 TAACCA

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    MYB-like sequence
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
MYB-like sequence Arabidopsis thaliana 127 + 6 TAACCA
MYB-like sequence Arabidopsis thaliana 1098 - 6 TAACCA
MYB-like sequence Arabidopsis thaliana 329 - 6 TAACCA

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    MYC
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
MYC Arabidopsis thaliana 71 - 6 CATGTG

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    STRE
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
STRE Arabidopsis thaliana 503 - 5 AGGGG

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    TATA
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TATA Arabidopsis thaliana 93 - 8 TATAAAAT
TATA Arabidopsis thaliana 863 - 8 TATAAAAT
TATA Arabidopsis thaliana 711 + 8 TATAAAAT

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    TATA-box
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
TATA-box Pisum sativum 94 - 7 TATAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 590 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Helianthus annuus 95 - 6 TATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 510 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Oryza sativa 592 + 8 TACATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 96 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 709 + 9 ccTATAAAaa core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 97 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Oryza sativa 133 - 8 TACATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Helianthus annuus 137 - 6 TATACA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 139 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Oryza sativa 180 - 7 TACAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 274 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 332 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 333 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 341 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 357 + 6 ATATAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 358 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 366 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 367 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Oryza sativa 369 + 7 TACAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 428 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 453 + 6 ATATAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 454 + 6 TATATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 455 + 6 ATATAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 456 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 507 - 7 TATATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 711 + 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 508 + 6 TATATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Oryza sativa 722 + 7 TACAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 757 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 785 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 800 - 6 TATATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 801 - 6 ATATAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 802 - 6 TATATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 804 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Helianthus annuus 855 - 6 TATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 856 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 857 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Pisum sativum 864 - 7 TATAAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Helianthus annuus 865 - 6 TATAAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 866 - 7 TATATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 867 - 6 TATATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 868 - 6 ATATAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 869 - 6 TATATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 871 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 1158 - 6 ATATAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1159 - 6 TATATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 1160 - 6 ATATAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1161 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1236 - 9 taTATAAAtc core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 1237 - 6 ATATAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1238 - 6 TATATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 1239 - 6 ATATAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1240 - 6 TATATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 1241 - 6 ATATAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1242 - 6 TATATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 1243 - 6 ATATAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1244 - 6 TATATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 1245 - 6 ATATAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1246 - 6 TATATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 1247 - 6 ATATAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1248 - 6 TATATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 1249 - 6 ATATAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1250 - 6 TATATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 1251 - 6 ATATAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1252 - 6 TATATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 1253 - 6 ATATAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1254 - 6 TATATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 1255 - 6 ATATAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1256 - 6 TATATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 1257 - 6 ATATAT core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1258 - 6 TATATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica oleracea 1259 + 6 ATATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1260 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Brassica napus 1484 + 6 ATTATA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1485 - 5 TATAA core promoter element around -30 of transcription start
TATA-box Arabidopsis thaliana 1486 - 4 TATA core promoter element around -30 of transcription start

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    Unnamed__1
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Unnamed__1 Zea mays 792 + 5 CGTGG
Unnamed__1 Zea mays 1283 + 5 CGTGG

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    Unnamed__2
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Unnamed__2 Zea mays 775 - 6 CCCCGG

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    Unnamed__4
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Unnamed__4 Petroselinum hortense 168 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 795 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 307 + 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 938 - 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 243 + 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 819 + 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 707 + 4 CTCC
Unnamed__4 Petroselinum hortense 1286 - 4 CTCC

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    Unnamed__6
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
Unnamed__6 Zea mays 1235 - 10 taTAAATATct

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG
    chs-CMA2a
Site Name Organism Position Strand Matrix score. sequence function
chs-CMA2a Petroselinum crispum 187 - 8 TCACTTGA part of a light responsive element

>003403
+ TAAAAATAGT GAAAGAACCA CCGGCCGGAT AAACAAGAGT AAAGCTGTCT GAAAATAAAC CCTACTCACA 


+ CACATGGTAT TTCTCATATT TTATTTTATA GTCAATTATT AAGATAATAA GCATTCTAAC CATTTATGTA 


+ TACATGTTCA TACCGCGAGC GTTGCTCGGA GGAACACATT TTTGTATCAA GTGATGTTGC AAAATGATGC 


+ ATACAATCAG TACACATCAC TCTAGCTACT TACTCCATCT TGTAGTATTG CAATGCAGTA AAATATAGCA 


+ CTAGTCCCAG ATTAATTATT ATGGTTCTCC TTTCAAACAC ATAGTTAATG GTTATAATGA TATACTTAAG 


+ GGCAAAATAT ATTACTTATA CAAAATAACT CGATGGGTTA CGTAAAATAC ATGAAGAATT CAGTTTAATA 


+ AGTTTAGTAT ATGCTTGCAT GAGTATGATA CAATATATAT GTGACAAAAT AAAATACAAG TCTAAATTTA 


+ CGACACCACC ACCCCCTTAT ATAGAGTTAA AACGTGAGAT TCAAGAGTGT AGTTGGTGGA AAAAGATAAA 


+ TTGTAGGGTT ATTGTCTTGT AGAAATACAT ATACATAAAT ATTTATCTGT ACAAGATGTG CGTATGTACA 


+ ATAATCATTG ACAATTAACC TAAACATTGC AATTAACATA AACTTTGTTT CTTCTTAAAT TTTAGATGGT 


+ AAGTTCCTCC TATAAAATCA TTACAAAATC ATAAAATCCC AATAACACAC TTTATCTATA CGCAAAAAAA 


+ TTTGCCGGGG AAAATATAGT ACGTGGAGGT ATATATAGTA CGTACTTTCT CCTTTGCTTT CAAAGATCAT 


+ CAAATTTTAA TTAGTTTATA TTATTTTATA TATACACACA CACACACACA CACAAAGTGT GTGAGACATT 


+ TTTTTTATTT TTGTTTTTGA AATAGAAGGA GAGAGGAAGA GAGTGAATTA GATTTTTTTT TTTTTTTAAT 


+ TAAAGATATG TTAAGATTAC ATGTAGGTGA GATTTTGAAA AAAAAAACAG CCAAATTTAG TTATGTGAAA 


+ TTACATTTTT GCCCCGTATT TATTATTCAT ATTTTGTTTT AATTAGATGG TTAAAGTGGT AATTTGATAG 


+ GATTTTAGTT TACAATGAGT GTTTTATTAA TTAGTAGATA TATATTAAGT ATGTATTTTC AATTAAAAAT 


+ AAAGAAAAAA AAGCAGCATC TAGCATGGCA AGCACAACAC AAGCAGATAT ATATATATAT ATATATATAT 


+ ATAATTGGAA AAGTATTGTT GTCGTGGAGA CAAATTTAGG TTCTTGAGCA AAAACTCAAC TACTCTCTAG 


+ AGAGAGAGAG AGAGAGAGGT AGCAGTAACA CGACTTGTGT AGAAATTGTG AGGGACGAAT CGGTTAAGAA 


+ GTGCATGTCT TGTATCTCTC TCTAGAGCTA GAAAAATCCT AAGTGTTTCA TTTTTTTTGG AACAAACACA 


+ GAAAACCCCA AGAATTATAA TAATTAAAC
- ATTTTTATCA CTTTCTTGGT GGCCGGCCTA TTTGTTCTCA TTTCGACAGA CTTTTATTTG GGATGAGTGT 


- GTGTACCATA AAGAGTATAA AATAAAATAT CAGTTAATAA TTCTATTATT CGTAAGATTG GTAAATACAT 


- ATGTACAAGT ATGGCGCTCG CAACGAGCCT CCTTGTGTAA AAACATAGTT CACTACAACG TTTTACTACG 


- TATGTTAGTC ATGTGTAGTG AGATCGATGA ATGAGGTAGA ACATCATAAC GTTACGTCAT TTTATATCGT 


- GATCAGGGTC TAATTAATAA TACCAAGAGG AAAGTTTGTG TATCAATTAC CAATATTACT ATATGAATTC 


- CCGTTTTATA TAATGAATAT GTTTTATTGA GCTACCCAAT GCATTTTATG TACTTCTTAA GTCAAATTAT 


- TCAAATCATA TACGAACGTA CTCATACTAT GTTATATATA CACTGTTTTA TTTTATGTTC AGATTTAAAT 


- GCTGTGGTGG TGGGGGAATA TATCTCAATT TTGCACTCTA AGTTCTCACA TCAACCACCT TTTTCTATTT 


- AACATCCCAA TAACAGAACA TCTTTATGTA TATGTATTTA TAAATAGACA TGTTCTACAC GCATACATGT 


- TATTAGTAAC TGTTAATTGG ATTTGTAACG TTAATTGTAT TTGAAACAAA GAAGAATTTA AAATCTACCA 


- TTCAAGGAGG ATATTTTAGT AATGTTTTAG TATTTTAGGG TTATTGTGTG AAATAGATAT GCGTTTTTTT 


- AAACGGCCCC TTTTATATCA TGCACCTCCA TATATATCAT GCATGAAAGA GGAAACGAAA GTTTCTAGTA 


- GTTTAAAATT AATCAAATAT AATAAAATAT ATATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTCACA CACTCTGTAA 


- AAAAAATAAA AACAAAAACT TTATCTTCCT CTCTCCTTCT CTCACTTAAT CTAAAAAAAA AAAAAAATTA 


- ATTTCTATAC AATTCTAATG TACATCCACT CTAAAACTTT TTTTTTTGTC GGTTTAAATC AATACACTTT 


- AATGTAAAAA CGGGGCATAA ATAATAAGTA TAAAACAAAA TTAATCTACC AATTTCACCA TTAAACTATC 


- CTAAAATCAA ATGTTACTCA CAAAATAATT AATCATCTAT ATATAATTCA TACATAAAAG TTAATTTTTA 


- TTTCTTTTTT TTCGTCGTAG ATCGTACCGT TCGTGTTGTG TTCGTCTATA TATATATATA TATATATATA 


- TATTAACCTT TTCATAACAA CAGCACCTCT GTTTAAATCC AAGAACTCGT TTTTGAGTTG ATGAGAGATC 


- TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA TCGTCATTGT GCTGAACACA TCTTTAACAC TCCCTGCTTA GCCAATTCTT 


- CACGTACAGA ACATAGAGAG AGATCTCGAT CTTTTTAGGA TTCACAAAGT AAAAAAAACC TTGTTTGTGT 


- CTTTTGGGGT TCTTAATATT ATTAATTTG